近日,我校五华三黄鸡科技创新中心与华南农业大学、中国科学院昆明动物研究所等多家院所合作开展的黄羽鸡群体基因组学研究取得进展。该研究成果以“Genome-wide genetic structure and selection signatures for color in 10 traditional Chinese yellow-feathered chicken breeds”为题于2020年4月20日在线发表在BMC Genomics上(https://doi.org/10.1186/s12864-020-6736-4)。我校五华三黄鸡科技创新中心黄勋和副教授、中国科学院昆明动物研究所博士生Newton O. Otecko(已毕业)和彭旻晟副研究员为共同第一作者。这是该家鸡遗传学联合研究团队继2018年发表在Science Bulletin上的第二篇合作成果。相关工作得到了广东省自然科学基金项目(2014A030307018)、广东省公益研究与能力建设项目(2016A030303068)以及云南省科技厅的资助。
黄羽鸡,又称“三黄鸡”,具有“喙黄、羽黄、脚黄”的明显特征。黄羽鸡在中国具有着悠久的饲养历史,早在公元540年前北魏时期的农学专著《齐民要术》上就有记载,至今已形成众多地方品种。黄羽鸡因皮薄、骨细软、肉多、肉滑、肉味鲜美的特点而深受广大消费者青睐。黄羽鸡占据了国内肉鸡行业的半壁江山,尤其是以两广为中心的华南地区为主要消费地,已经成为我国重要的畜禽资源。研究结果显示,黄羽鸡存在明显的群体遗传结构,主要分为三个分支:北部、中部和南部,与地理位置相对应(图1)。全基因组选择信号扫描分析检测出RALY、LGR4、SLC23A2、SLC2A14、BCDO2、RYR2、IL-18、FBXO5、COL1A2等基因在黄羽鸡群体中受到选择作用。其中,BCDO2被报道与家鸡黄色皮肤性状相关,而RYR2、IL-18、FBXO5、COL1A2等基因则与肉质有关。相关结果可为今后制定黄羽鸡遗传育种和保护策略提供参考依据。
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